自然界中低聚異麥芽糖極少以游離狀態存在，但作為支鏈淀粉或多糖的組成部分，在某些發酵食品如醬油、黃酒或酶法葡萄糖漿中有少量存在。 工業上以淀粉為原料生產低聚異麥芽糖需要一種酶，此酶為α-葡萄糖苷酶，又名葡萄糖基轉移酶，簡稱α-糖苷酶。它能切開麥芽糖和麥芽低聚糖分子結構中α-1，6糖苷鍵，并能將游離出來的一個葡萄糖殘基轉移到另一個葡萄糖分子或麥芽糖或麥芽三糖等分子中的α-1，6位上，形成異麥芽糖、異麥芽三糖、異麥芽四糖、異麥芽五糖和潘糖等。 低聚異麥芽糖振動篩，低聚異麥芽糖篩粉機